تُدفع رسوم التحكم في المحطة لأداء عمليات مراقبة الحركة الجوية للاقتراب والمطار، بما في ذلك استخدام المساعدات الراديوية المتأصلة في الهبوط أو الإقلاع، من قبل NAV Portugal. يتم تحديده لكل طن متري من الوزن الأقصى للإقلاع.

ابتداءً من العام المقبل، ستدفع شركات الطيران رسوم وحدة قدرها 171.57 يورو، بزيادة 8.27 يورو عن 163.30 يورو المحددة لعام 2023. أدت هذه الزيادة إلى مقاطعة سلسلة من الانخفاضات في هذه التكلفة، مما أدى إلى خفض الرسوم من 180.70 يورو في عام 2023 إلى 163.30 يورو في العام الماضي

.

تُطبق الرسوم على الخدمات المقدمة في مطارات لشبونة وبورتو وفارو وماديرا وبورتو سانتو وسانتا ماريا وبونتا ديلجادا وهورتا وفلوريس، بالإضافة إلى مطار كاسكايس المحلي.

ومن الناحية الانتقالية، وإلى حين نشر تشريع محدد، يتم تحديد الرسوم النهائية وتحديدها بموجب مرسوم من عضو الحكومة المسؤول عن مجال النقل، بعد رأي من الهيئة الوطنية للطيران المدني (ANAC).

كما تم بالفعل تحديد الرسوم التي ستفرضها ANA. أعلنت ANAC (الهيئة الوطنية للطيران المدني) في التاسع عشر أنها قررت الموافقة على اقتراح التعريفة الذي قدمه صاحب الامتياز لمطاري بورتو وفارو، والذي «بشكل عام، يمثل متوسط زيادة بنسبة 2.40٪ في الرسوم المنظمة» في هاتين البنيات التحتية. في مطار لشبونة، «تُظهر الرسوم المنظمة، بشكل عام، زيادة متوسطة تبلغ حوالي 0.65٪»

.

قررت ANAC عدم الموافقة على التعديلات المقترحة على رسوم PMR (للخدمات للأشخاص ذوي القدرة المحدودة على الحركة)، ورسوم الأمن، ورسوم الهبوط.