Les données sont contenues dans un rapport de l'Institut national de la santé Docteur Ricardo Jorge (INSA) sur la diversité génétique du virus qui cause le Covid-19, publié aujourd'hui et qui confirme que Delta était déjà la variante prévalente dans la semaine du 21 au 27 juin. "Comme prévu, sa fréquence a augmenté dans toutes les régions" au cours du dernier mois, avec une "forte augmentation" dans le Nord, où il représente déjà 71,1 pour cent des infections, à Madère (85,7 pour cent ) et dans les Açores (64,7 pour cent) , avance l'institut.

Ces derniers jours, le Portugal a accéléré le rythme de la vaccination contre le Covid-19 pour répondre à la propagation rapide de la variante Delta, considérée comme 60 % plus transmissible que la variante Alpha, la "task force" qui coordonne la logistique visant à administrer environ 850 000 doses par semaine. Selon l'INSA, sur le total des séquences de la variante Delta analysées, 55 présentent la mutation supplémentaire K417N dans la protéine "spike" (sous lignée AY.1En ce qui concerne la variante Alpha, initialement associée au Royaume-Uni et qui est devenue prédominante au Portugal, l'INSA a déclaré que "sa fréquence continue de diminuer fortement à l'échelle nationale", avec une fréquence relative de 9,8 %.La fréquence relative des variants Beta et Gamma, initialement associés à l'Afrique du Sud et au Brésil (Manaus), respectivement, reste faible et sans tendance à la hausse dans les derniers échantillonnages nationaux", indique également le rapport.

Parmi les autres variants d'intérêt déjà détectés au Portugal, l'institut signale la circulation du variant de la lignée B.1.621, initialement détecté en Colombie, qui présentait des fréquences relatives comprises entre 1 % et 0,4 %, ainsi que le Lambda, avec une circulation marquée au Pérou et au Chili, qui n'a été détecté que dans deux cas au Portugal depuis avril de cette année. L'INSA a déjà analysé 10 824 séquences du génome du nouveau coronavirus, obtenues à partir d'échantillons collectés dans plus de 100 laboratoires, hôpitaux et institutions, représentant 288 municipalités du Portugal.

En juin, l'institut a annoncé un renforcement de la surveillance des variantes du virus responsable du covid-19 en circulation au Portugal, par le biais de sa surveillance continue. Cette nouvelle stratégie permet une meilleure caractérisation génétique du SRAS-CoV-2, puisque les données seront analysées en continu, et qu'il n'y aura plus d'intervalles de temps entre les analyses, qui étaient essentiellement consacrées à des études spécifiques de caractérisation génétique demandées par la santé publique.