Le début de l'épidémie au Portugal a été marqué par la "diffusion massive" d'un variant du SRAS-CoV-2 avec une mutation spécifique, qui a commencé à circuler dans les régions du Nord et du Centre plus d'une semaine avant le diagnostic des premiers cas.

Cette conclusion fait partie de l'"Étude de la diversité génétique du nouveau coronavirus SRAS-CoV-2 au Portugal", publiée aujourd'hui lors de la conférence de presse régulière de la DGS pour mettre à jour les informations sur la pandémie au Portugal, un projet de recherche coordonné par l'Institut national de la santé Dr. Ricardo Jorge (INSA), pour analyser la diversité génétique du nouveau coronavirus, qui cause la maladie covid-19, surtout pendant les premiers mois de l'épidémie.

Les premiers résultats de l'étude, qui a déjà analysé 1 785 séquences du génome du nouveau coronavirus, révèlent que "le début de la pandémie au Portugal a été caractérisé par la diffusion massive d'un variant du SRAS-CoV-2 avec une mutation spécifique de la protéine "Spike"", qui a fait l'objet de recherches et qui est le principal objectif du vaccin car il est responsable de la liaison du virus aux cellules humaines, permettant ainsi l'infection.

Cette variante "D839Y" du SRAS-CoV-2 sera entrée au Portugal, dans le Nord et le Centre, "vers le 20 février, associée à un voyage en Italie, plus précisément dans la région de Lombardie", a déclaré le coordinateur de la recherche, João Paulo Gomes.

"Elle aura circulé de manière un peu incontrôlée, ou du moins non détectée dans ces régions du pays, et aura provoqué une propagation massive et une série de chaînes de transmission avant que les premiers cas ne soient signalés au Portugal", a déclaré le coordinateur de l'étude.

Les premiers cas de covid-19 ont été signalés le 2 mars, un associé à l'hôpital de Santo António et un autre à l'hôpital de São João, à Porto, mais ils ne sont pas liés au "D839Y".

"Cela a donc commencé bien avant, nous n'avons aucun doute", a déclaré l'enquêteur de l'INSA.

L'exemple le plus notoire de sa propagation a été l'épidémie dans la municipalité d'Ovar, où la mise en place d'une clôture sanitaire aurait empêché sa propagation à d'autres régions du pays.

"Pendant la phase exponentielle de la pandémie au Portugal, qui a eu lieu essentiellement en mars et dans les premiers jours d'avril, elle [la variante] a atteint 33% des cas certains jours, 3% de tous les cas avaient cette mutation, et dans les données cumulées, nous avons calculé que le 9 ou le 10 avril, cette mutation était présente chez environ 4.000 personnes atteintes de covid-19", a-t-il souligné.

Pour le chercheur, cela peut être "un excellent modèle" pour comprendre comment tout a commencé, comment l'infection se propage et "l'importance de certaines mesures prises au bon moment".

Il a également estimé que si les mesures avaient été "un peu anticipées, elles auraient fonctionné encore mieux", mais qu'à l'époque, il n'y avait pas de données pour les justifier.

"Maintenant, avec ces modèles et avec ces résultats, nous savons qu'en fait, quelques jours auparavant, de nombreuses chaînes de transmission, de nombreuses hospitalisations, de nombreuses infections en général auraient été évitées".

Pour le chercheur, "ce type d'analyse rétrospective, menée à une échelle sans précédent au Portugal, peut être utilisé comme un "atout" pour lutter dans des situations futures, que ce soit dans une deuxième vague de covid-19, ou dans d'autres épidémies possibles".

"Ses conclusions nous serviront surtout de leçon pour préparer un avenir proche ou lointain, cela ne veut pas dire qu'elles sont d'application immédiate", a déclaré João Paulo Gomes lors de la conférence de presse.

"Il sera très important pour nous tous de comprendre exactement comment nous en sommes arrivés là et dans quelle mesure les mesures de santé publique ont été opportunes et efficaces", a-t-il déclaré.

L'étude, financée dans le cadre de la première édition du programme de soutien à Research4Covid, bénéficie de la participation de plus de 60 hôpitaux/laboratoires dans tout le pays.