מרקו טרונקון, מנכ"ל Aeroporti di Roma, המנהל את שדות התעופה פיומיצ'ינו וצ'יאמפינו, אמר כי חיוני להשעות באופן זמני בדיקות ביומטריות מסוימות כדי למנוע צווארי בקבוק חמורים בשיא הקיץ.

הוא דירג את רמת הסיכון הנוכחית על "שמונה או תשע" בסולם של אחד עד עשר, וטען כי תהליך הרישום החדש לנוסעים מחוץ לאיחוד האירופי אינו עולה בקנה אחד עם תזרימי התנועה הצפויים; כתוצאה מכך, הפתרון היחיד הוא "לפתוח את השסתום", שכן השלמת כל הרישומים הנדרשים אינה אפשרית.

ה- EES נכנס לתוקף באמצע אפריל בעקבות עיכובים חוזרים ונשנים ומחייב אזרחי מדינות שאינן באיחוד לספק טביעות אצבע ותצלומים עם כניסתם הראשונה לאזור שנגן, במטרה לחזק את ביטחון הגבולות החיצוניים של הגוש.

אולם מאז השקתה, הפלטפורמה סבלה מתקלות טכניות כרוניות, מה שהוביל לתורים ארוכים בשדות תעופה עוד לפני עונת השיא.

סוגיות מרכזיות שצוטטו על ידי המפעילים כוללות תקלות בקיוסקים בשירות עצמי ושגיאות שמאלצות נוסעים שכבר נרשמו לחזור על התהליך כולו. אוליבייה ינקובץ, מנכ"ל איגוד שדות התעופה ACI אירופה, מתח ביקורת ישירה על סוגיות אוטומציה אלה והדגיש כי המערכות האוטומטיות אינן מתפקדות כמתוכנן

.

החששות מפני צוואר בקבוק מבצעי משתרעים ברחבי אירופה. איגוד התחבורה האווירית הבינלאומי (IATA) הזהיר כי זמני ההמתנה עשויים להגיע לשש שעות בשדות התעופה שנפגעו קשות ביותר

.

בתגובה לתרחיש משבר זה, כמה מפעילים כבר החלו ליישם קריטריונים חריגים מיוזמתם: מוקדם יותר החודש, שדות תעופה ביוון אפשרו לאזרחים בריטים לעקוף נהלי EES כדי להקל על העומס בבנייני הטרמינל.

חששות אלה משפיעים גם על מרכזים מרכזיים מחוץ לאיחוד האירופי, כמו לונדון ואיסטנבול, שם מנהלים מודאגים מאפקט דומינו עולמי של עיכובים בטיסות. סלהטין בילגן, מנכ"ל נמל התעופה באיסטנבול, אישר את ההשפעה השלילית וציין כי נוסעים טורקים רבים נתקלים במכשולים משמעותיים במהלך האינטראקציות הראשוניות שלהם עם המערכת האירופית

.

לעומת זאת, הנציבות האירופית דוחה את תרחיש הקריסה וטוענת כי המערכת פועלת במלואה בכל מדינות שנגן.

דובר הנציבות טען כי זמני ההמתנה שנצפו נובעים מבעיות מבניות קיימות מראש, כגון מחסור בכוח אדם במכס, מגבלות תשתיות פיזיות וריכוז מופרז של טיסות באותן משבצות זמן.

עם זאת, בריסל ציינה כי המסגרת הרגולטורית הנוכחית כבר מספקת למדינות החברות מנגנוני גמישות משפטיים, ומאפשרת להן להשעות באופן זמני את איסוף הנתונים הביומטריים בכל פעם שהזרימה החלקה של תעבורת הגבול נמצאת בסיכון, ובכך להטיל את אחריות קבלת ההחלטות על הרשויות הלאומיות.