Volgens SIC Notícias wordt landingsbaan 2 gebouwd naast een beek die ook het terrein tussen de toekomstige landingsbanen 3 en 4 doorkruist. Daarom zal de waterloop moeten worden omgelegd, wat de kosten van het project zal verhogen.

Daarom zijn de start- en landingsbanen die links van de Alcochete Shooting Range zouden komen te liggen, omgelegd en liggen ze nu parallel aan de nationale weg 10 en de snelweg A13.

Experts, geciteerd door SIC Notícias, zeggen ook dat onder de Alcochete Shooting Range een van de grootste zoetwaterreserves van het Iberisch schiereiland ligt, die vervuild zou kunnen raken door de aanleg van de Luís de Camões Airport.

De milieueffectrapportage is echter nog niet afgerond en kan nog wel een jaar duren.