Ze bracht een groot deel van haar jeugd door aan het hof van haar oudoom, de Engelse koning Edward de Belijder. Haar familie vluchtte voor Willem de Veroveraar en leed schipbreuk voor de kust van Schotland. Koning Malcolm sloot vriendschap met hen en raakte in de ban van de mooie, gracieuze Margaret. Ze trouwden in het kasteel van Dunfermline in 1070.

Malcolm was goedhartig, maar ruw en onbeschaafd, net als zijn land. Door Malcolms liefde voor Margaret was zij in staat zijn humeur te verzachten, zijn manieren op te poetsen en hem te helpen een deugdzame koning te worden. Hij liet alle huishoudelijke zaken aan haar over en raadpleegde haar vaak in staatszaken.

Margaret probeerde haar adoptieland te verbeteren door kunst en onderwijs te bevorderen. Voor religieuze hervormingen moedigde ze synoden aan en was ze aanwezig bij de discussies die misbruik binnen het priesterschap en leken probeerden te stoppen. Samen met haar man stichtte ze verschillende kerken.

Margaret was niet alleen koningin, maar ook moeder. Zij en Malcolm kregen zes zonen en twee dochters. Margaret hield persoonlijk toezicht op hun godsdienstonderwijs en andere studies.

Hoewel ze erg betrokken was bij de zaken van het huishouden en het land, bleef ze los van de wereld. Haar privéleven was sober. Ze had bepaalde tijden voor gebed en het lezen van de Schrift. Ze at spaarzaam en sliep weinig om tijd te hebben voor haar devoties.

In 1093 deed koning William Rufus een verrassingsaanval op kasteel Alnwick. Koning Malcolm en zijn oudste zoon Edward werden gedood. Margaret, die al op haar sterfbed lag, stierf vier dagen na haar man.

Feestdag 16 november.