Departamentul de Boli Infecțioase de la Institutul Național de Sănătate Ricardo Jorge (INSA) a analizat deja 13.256 secvențe ale genomului noului coronavirus, obținute din probe colectate în mai mult de 100 de laboratoare, spitale și instituții, reprezentând 297 de municipalități din Portugalia. „Printre noile secvenţe analizate, varianta Delta (B.1.617.2) este cea mai răspândită variantă din Portugalia, cu o frecvenţă de 98,3% în săptămâna 29 (19-25 iulie) fiind peste 95% în toate regiunile”, afirmă „Raportul privind diversitatea genetică a noului SARS-COV-2 coronavirus in Portugalia” publicat astăzi pe site-ul INSA.

Conform datelor, frecvența relativă a variantei Delta în această perioadă a fost de 100% în nordul, Algarve și regiunea autonomă Madeira, 97,6% în regiunile Centru și Alentejo, 97,2% în Lisabona și Vale do Tejo și 95 la sută în Regiunea Autonomă Azore. Cercetătorii INSA spun că, din secvenţele totale de variante Delta analizate până în prezent, 62 au mutaţia suplimentară K417N în proteina Spike (sublineul AY.1). „Acest sublineag a menţinut o frecvenţă relativă sub 1% din săptămâna 24 (14-20 iunie), şase cazuri fiind detectate în perioada săptămânilor 28 (12-18 şi 29 iulie) şi 29 iulie (19-25 iulie)”, se referă aceştia.

Raportul privind diversitatea genetică SARS-COV-2 indică, de asemenea, faptul că frecvența relativă a variantelor Beta (B.1.351) și Gamma (P.1), asociate inițial cu Africa de Sud și Brazilia (Manaus), menține, este în scădere și fără o tendință de creștere. Ambele au avut o frecvență de 0,4% în săptămâna 29, conform datelor colectate până în prezent, subliniază, adăugând că nu au fost detectate cazuri noi ale variantei Lambda (C.37), care a marcat circulația în regiunile Peru și Chile.

Printre alte variante de interes în circulație în Portugalia, INSAevidențiază variantele B.1.621, detectate inițial în Columbia, și Eta (B.1.525), inițial detectate în Nigeria, care au mutații în proteina Spike, care sunt împărtășite cu unele dintre variantele îngrijorătoare. Aceste variante au o frecvență scăzută în Portugalia, fiind detectate sub 0,8 la sută (B.1.621) sau 0,3 la sută (Eta B.1.525) din săptămâna 25 (21-27 iunie), afirmă documentul.

Ca parte a monitorizării continue a diversității genetice a SARS-COV-2 pe care INSA o dezvoltă, o medie de 601 secvențe pe săptămână a fost analizată de la începutul lunii iunie 2021. Această prelevare a probelor a implicat laboratoare distribuite în cele 18 districte ale continentului și în regiunile autonome Azore și Madeira, acoperind în medie 118 municipalități pe săptămână.

Începând cu luna iunie, INSAa adoptat o nouă strategie pentru monitorizarea continuă a diversității genetice a noului coronavirus din Portugalia, care se bazează pe eșantionarea săptămânală la nivel național. „Această abordare va permite o mai bună caracterizare genetică a SARS-COV-2, deoarece datele vor fi analizate continuu şi nu vor mai exista intervale de timp între analize”, subliniază institutul.