Enligt den senaste lägesrapporten om den genetiska mångfalden av SARS-CoV-2 i Portugal, som offentliggjorts av INSA, har Deltavarianten, som ursprungligen förknippades med Indien, "ökat dramatiskt" i relativ frekvens på nationell nivå, men dess fördelning "är fortfarande mycket heterogen mellan olika regioner".

Enligt INSA varierar spridningen av deltavarianten mellan 3,2 procent (Azorerna) och 94,5 procent (Alentejo), men med hänsyn till den trend som observerats mellan maj och juni "förväntas denna variant bli dominerande på hela det nationella territoriet under de kommande veckorna".

Av det totala antalet sekvenser av Deltavarianten som hittills analyserats har 46 den extra K417N-mutationen i Spike-proteinet, uppger institutet.

Han betonar dock att cirka 50 procent av dessa fall är begränsade till endast två lokala överföringskedjor, vilket tyder på att deras spridning i samhället fortfarande är begränsad, med den relativa frekvensen av denna profil (Delta+K417N) i det nationella provet June 2,3 procent.

Enligt rapporten upptäcktes bland de nya sekvenser som analyserats alfavarianten (B.1.1.1.7), som ursprungligen förknippades med Storbritannien, genom sekvensering med en relativ frekvens på 40,2 procent i det nationella provet i juni, vilket visar på en kraftig minskning av närvaron i hela landet (88,4 procent i maj).

INSA förklarar dock att "denna variant fortfarande är mest förekommande i den norra regionen (62,7 procent) och i de autonoma regionerna Azorerna (96,8 procent) och Madeira (69,8 procent)".

I Ricardo Jorge-institutets rapport rapporteras också att den relativa frekvensen av varianterna Beta (B.1.351) och Gamma (P.1) fortfarande är låg och att det inte finns någon uppåtgående trend i de senaste provtagningarna.

"Det är särskilt anmärkningsvärt att betavarianten upptäcktes med en frekvens på 0,1 procent och i endast två regioner (Lissabon och Vale do Tejo och Região Autónoma da Madeira)", säger han.

Enligt dokumentet har hittills 9 846 sekvenser av det nya coronavirusets genom analyserats, som erhållits från prover som samlats in i mer än 100 laboratorier, sjukhus och institutioner, som representerar 284 kommuner i Portugal.

Som en del av den genomiska övervakning som INSA samordnar har 1 087 sekvenser erhållits från den nationella provtagningen för juni 2021, som ägde rum mellan den 2 och 15 juni. Provtagningen omfattade laboratorier som var fördelade över de 18 distrikten på Portugals fastland och de autonoma regionerna Azorerna och Madeira, vilket omfattar totalt 131 kommuner.