Enligt den senaste lägesrapporten om den genetiska mångfalden hos det nya coronaviruset SARS-CoV-2 i Portugal har 62 av de totalt analyserade sekvenserna av Delta-varianter den extra K417N-mutationen i Spike-proteinet (det så kallade Delta Plus), som har bibehållit en relativ frekvens på under 1 procent under veckan mellan den 14 och 20 juni.

Inget fall upptäcktes under den vecka som analyserades mellan den 26 juli och den 1 augusti (vecka 30), rapporterar det nationella hälsoinstitutet (INSA).

Enligt INSA-rapporten har man hittills analyserat 13 807 sekvenser av det nya coronavirusets genom, som erhållits från prover som samlats in i mer än 100 laboratorier, sjukhus och institutioner, som representerar 298 kommuner i Portugal.

Institutet uppger också att i genomsnitt 588 sekvenser per vecka har analyserats sedan början av juni och att dessa prover har tagits av laboratorier som är fördelade över de 18 distrikten på Portugals fastland och de autonoma regionerna Azorerna och Madeira, vilket motsvarar i genomsnitt 118 kommuner per vecka.

Bioinformatikkärnan vid avdelningen för infektionssjukdomar vid det nationella hälsoinstitutet Ricardo Jorge(INSA) har redan analyserat 13 807 sekvenser av det nya coronavirusets arvsmassa, som erhållits från prover som samlats in i mer än 100 laboratorier, sjukhus och institutioner, som representerar 298 kommuner i Portugal.

Rapporten om den genetiska mångfalden av SARS-CoV-2 visar att frekvensen av Deltavarianten uppgår till 100 procent i regionerna Lissabon och Vale do Tejo, Alentejo och Algarve samt i de autonoma regionerna Azorerna och Madeira.

Det anges också att "den relativa frekvensen av varianterna Beta (B.1.351) och Gamma (P.1), som ursprungligen förknippades med Sydafrika respektive Brasilien (Manaus), förblir låg och utan en växande trend, utan att något fall av en stam har upptäckts vid vecka 30, enligt uppgifterna".

INSA tillägger att inga nya fall av Lambdavarianten (C.37) har upptäckts, "som har cirkulation i regionerna Peru och Chile".

Bland andra "varianter av intresse" som cirkulerar i Portugal lyfter INSA fram varianterna B.1.621 (först upptäckt i Colombia) och Eta (B.1.525 - ursprungligen upptäckt i Nigeria), som har mutationer i Spike-proteinet som delas med några av de "oroande varianterna".

Dessa varianter har dock en låg frekvens i Portugal och har upptäckts i mindre än 0,8 procent (B.1.621) eller 0,3 procent (Eta B.1.525) sedan vecka 25 (21-27 juni).

Sedan juni har Ricardo Jorge-institutet antagit en ny strategi för kontinuerlig övervakning av den genetiska mångfalden hos det nya coronaviruset i Portugal, som bygger på veckovisa provtagningar av nationell omfattning.