Ricardo Jorge Ulusal Sağlık Enstitüsü'nde (INSA) Enfeksiyon Hastalıkları Bölümü, 100'den fazla laboratuvar, hastane ve kurumlarda toplanan örneklerden elde edilen yeni koronavirüsün genomunun 13.256 dizisini zaten analiz etmiştir. Portekiz'de 297 belediyeyi temsil ediyor. “Analiz edilen yeni diziler arasında, Delta varyantı (B.1.617.2), Portekiz'de 29. haftada (19 ila 25 Temmuz) yüzde 98,3 frekans ile en yaygın varyantı, tüm bölgelerde yüzde 95'in üzerinde”, “Yeni SARS-CoV-2'nin genetik çeşitliliğine ilişkin durum raporu Portekiz'de coronavirus” bugün INSA web sitesindeyayınlandı.

Verilere göre, bu dönemdeki Delta varyantının göreceli sıklığı Madeira'nın Kuzey, Algarve ve ve Özerk Bölgesi'nde yüzde 100, Merkez ve Alentejo bölgelerinde yüzde 97,6, Lizbon ve Vale do Tejo'da yüzde 97,2, Azorların Özerk Bölgesi'nde yüzde 95 idi. INSA araştırmacıları, bugüne kadar analiz edilen toplam Delta varyant dizilerinin 62'nin Spike proteininde ilave K417N mutasyonuna (AY.1 altyazı) sahip olduğunu söylüyorlar. “Bu alt çizgi, 24. haftadan (14-20 Haziran) bu yana yüzde 1'in altında göreceli bir sıklığı korudu ve 28 (12 - 18 ve 29 Temmuz) ve 29 (19 Temmuz - 25) hafta döneminde altı vaka tespit edildi.)”

SARS-CoV-2 genetik çeşitlilik raporu, sırasıyla Güney Afrika ve Brezilya (Manaus) ile ilişkili olan Beta (B.1.351) ve Gamma (P.1) değişkenlerinin göreceli sıklığının aşağı ve yükselen bir eğilim olmadan olduğunu göstermektedir. Her ikisi de bugüne kadar toplanan verilere göre 29. haftada yüzde 0,4'lük bir frekansa sahipti, Peru ve Şili bölgelerinde dolaşımı gösteren Lambda varyantının (C.37) yeni vakalarının tespit edilmediğini ekledi.

Portekiz'de dolaşımdaki diğer ilgi varyantları arasında, INSAbaşlangıçta Kolombiya'da tespit edilen B.1.621 ve başlangıçta Nijerya'da tespit edilen Eta (B.1.525), Spike proteininde mutasyonlara sahip olan bazı endişe verici varyantlar. Bu varyantlar Portekiz'de düşük bir frekansa sahip olup, 25 haftadan (21-27 Haziran) bu yana yüzde 0,8 (B.1.621) veya yüzde 0,3 (Eta B.1.525) altında tespit edilmiştir.

INSA'nın gelişmekte olduğu SARS-CoV-2'nin genetik çeşitliliğinin sürekli izlenmesinin bir parçası olarak, Haziran 2021'in başından bu yana haftada ortalama 601 sekansı analiz edilmiştir. Bu örnekleme, kıtanın 18 ilçesi ve Azorlar ve Madeira'nın özerk bölgeleri boyunca dağıtılan laboratuvarlar ve haftada ortalama 118 belediyeyi kapsar.

Haziran ayı itibarıyla INSA, haftalık ülke çapında örneklemeye dayanan Portekiz'deki yeni koronavirüsün genetik çeşitliliğinin sürekli izlenmesi için yeni bir strateji benimsemiştir. “Bu yaklaşım SARS-CoV-2 daha iyi bir genetik karakterizasyonu sağlayacak, veri sürekli olarak analiz edilecektir, ve artık analizler arasında zaman aralığı olacak”, enstitü vurgulamaktadır.