قبل تعيينه وزيرًا للخارجية في يوليو 2021، كان خوان فرنانديز تريجو رئيسًا للبعثة في السفارة الإسبانية في فنزويلا عندما تُرك التمثيل بدون سفير، حيث لم تعترف حكومة مدريد بشرعية نظام نيكولاس مادورو.

طوال مسيرته الدبلوماسية، كان السفير الإسباني في هايتي وباراغواي وكوبا والسفير الرئيسي لبعثة الاتحاد الأوروبي في أوروغواي.

من عام 2017 إلى عام 2018، كان خوان فرنانديز تريغو عضوًا استشاريًا في مكتب الشؤون الخارجية والتعاون، ومنسقًا لتطبيق المادة 155 في الدستور الإسباني.