Le rapport hebdomadaire sur la diversité génétique du nouveau coronavirus de l'Institut National de la Santé Docteur Ricardo Jorge (INSA) indique que la variante Delta, originaire de l'Inde et considérée comme la plus transmissible, a une "fréquence relative de 100% dans la semaine du 6 au 12 septembre dans toutes les régions" du pays.

Selon le document, sur le total des séquences analysées de cette variante à ce jour, 66 présentaient une mutation supplémentaire dans la protéine "spike", une sous-lignée connue sous le nom de "Delta Plus", mais aucun cas n'a été signalé ces dernières semaines.

En ce qui concerne le variant Gamma, associé au Brésil, après trois semaines sans être détecté dans les échantillons analysés, deux cas non apparentés ont été enregistrés dans les régions de l'Alentejo et de Lisbonne et Vale do Tejo dans la semaine du 30 août au 5 septembre.

La variante Alpha, originaire du Royaume-Uni et devenue prévalente au Portugal, n'est plus en circulation depuis cinq semaines, selon les données de l'INSA.

Delta, Gamma, Beta et Alpha sont classées par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) comme des variantes préoccupantes (VOC) parce qu'elles peuvent être plus transmissibles, causer une maladie plus grave ou avoir des caractéristiques qui permettent d'échapper au système immunitaire, avec une réduction potentielle de l'efficacité des vaccins.

Dans le cadre de la surveillance continue de la diversité génétique du SRAS-CoV-2, une moyenne de 552 séquences par semaine a été analysée depuis le début du mois de juin, à partir d'échantillons collectés de manière aléatoire dans des laboratoires des 18 districts du Portugal continental, des Açores et de Madère, couvrant une moyenne de 128 comtés par semaine.

En juin, l'institut a annoncé un renforcement de la surveillance des variantes du virus qui cause le covid-19 en circulation au Portugal, par le biais de son contrôle continu.

Selon l'INSA, cette stratégie a permis une meilleure caractérisation génétique du SRAS-CoV-2, puisque les données sont analysées en continu, et qu'il n'y a plus d'intervalles de temps entre les analyses, qui étaient essentiellement consacrées à des études spécifiques de caractérisation génétique demandées par la santé publique.