Из сотен мутаций SARS-CoV-2, выявленных во время пандемии, внимание органов здравоохранения Португалии приковано к четырем вариантам, вызывающим беспокойство - Альфа, Бета, Гамма и Дельта, - присутствующим в Португалии с общинной передачей.

Альфа, ассоциируемый с Великобританией, был первым из этих вариантов, получившим широкое распространение в Португалии, и, по оценкам, в мае он был ответственен почти за 90 процентов случаев заражения новым коронавирусом в стране.

Совсем недавно внимание было обращено на вариант Delta, первоначально обнаруженный в Индии, который считается более трансмиссивным и который, по данным национальных органов здравоохранения, может превзойти Alpha и стать самым распространенным в Португалии в течение нескольких недель.

По данным Европейского центра по профилактике и контролю заболеваний (ECDC), к концу августа на долю Delta-варианта SARS-CoV-2 придется 90% новых случаев заражения в Европе и увеличение числа госпитализаций и смертей.

Варианты, вызывающие озабоченность Всемирной организации здравоохранения

В настоящее время Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) классифицировала четыре "варианта, вызывающих озабоченность" (VOC), присвоив в конце мая обозначение буквами греческого алфавита для облегчения понимания.

Таким образом, к категории ЛОС относятся Альфа, первоначально обнаруженный в Великобритании в декабре 2020 года, Бета, ассоциируемый с Южной Африкой с декабря 2020 года, Гамма, выявленный в Бразилии в январе 2021 года, и Дельта, происходящий из Индии и классифицированный как вызывающий озабоченность в мае этого года.

Вариант считается вызывающим озабоченность, если имеет место одно или несколько из следующих условий: повышенная трансмиссивность вируса, повышенная вирулентность или клинические изменения в заболевании, а также снижение эффективности мер социального и общественного здравоохранения, диагностики, вакцин и доступных методов лечения.

В дополнение к ЛОС, ВОЗ классифицировала семь других изменений вируса SARS-CoV2 как "варианты, представляющие интерес" (VOI), последний из которых - Lambda, связанный с Перу.

Остальные шесть ВИО - Эпсилон (США, первоначально обнаружен в марте 2020 года), Зета (Бразилия, апрель 2020 года), Эта (несколько стран с декабря 2020 года), Тета (Филиппины, январь 2021 года), Йота (США, ноябрь 2020 года) и Каппа (Индия, октябрь 2020 года).

Вариант считается интересным, если он был идентифицирован как причина передачи в сообществе и обнаружен в нескольких странах.

Варианты с общинной передачей в Португалии

Четыре варианта, классифицированные ВОЗ как вызывающие озабоченность - Альфа, Бета, Гамма и Дельта - присутствуют в Португалии и имеют общинную передачу, то есть когда происходят случаи, когда невозможно проследить происхождение инфекции.

По предварительным июньским данным Национального института здравоохранения имени доктора Рикардо Хорхе (INSA), распространенность варианта Delta (B.1.617.2, ассоциируется с Индией) составляет более 60 процентов в регионе Лиссабона и Вале-ду-Тежу, однако на севере страны она все еще составляет менее 15 процентов.

По оценкам INSA, степень передаваемости варианта Delta примерно на 60 процентов выше, чем варианта Alpha, ассоциированного с Великобританией, который преобладал в Португалии в мае.

Однако институт прогнозирует, что Дельта, имеющая многочисленные мутации в белке "спайк", что делает ее более способной к передаче и уклонению от иммунной системы, может обогнать Альфу в ближайшие недели.

Что касается Бета, связанного с Южной Африкой, и Гамма, выявленного в Манаусе, Бразилия, то до 16 июня было выявлено 133 случая и 146 случаев соответственно, причем эти два варианта также передаются в стране по сообществам.

Влияние вариантов на эффективность вакцины

Вариант Delta нового коронавируса SARS-CoV-2 уже циркулирует в 92 странах, как указывает ВОЗ, гарантируя, что вакцины остаются эффективными против этого штамма, предотвращая случаи серьезных заболеваний и смерти.

По словам технического руководителя по реагированию на covid-19 в ВОЗ, Марии Ван Керкхове, в понедельник, вариант Delta "распространяется быстро" и "обладает большей передаваемостью, чем вариант Alpha", первоначально диагностированный в Великобритании.

Мария Ван Керкхове сказала, что вакцины "работают против варианта Дельта", поскольку, как и в случае с другими штаммами вируса, они предотвращают тяжелую форму ковид-19 и смерть, если цикл вакцинации завершен.

Вирусолог Педро Симас также считает, что до сих пор не существует варианта коронавируса SARS-CoV-2, который "нарушает защитный эффект" вакцин против covid-19, подчеркивая, что все они эффективны в предотвращении тяжелых заболеваний и смерти.

"Это не значит, что очень редкие случаи не появляются, но мы не можем сосредоточиться на редких, и теперь мы должны смотреть на общее благо", - сказал эксперт в интервью Lusa.

Недавно Генеральное управление здравоохранения (DGS) решило сократить интервал для введения второй дозы вакцины Astrazeneca с 12 до восьми недель, чтобы обеспечить "более быструю защиту" от передачи новых "проблемных вариантов" SARS-вируса. CoV-2.

Согласно DGS, график вакцинации вакциной VAXZEVRIA (прежнее название Astrazeneca) состоит из двух доз с интервалом от восьми до 12 недель, "интервал в восемь недель в настоящее время рекомендуется для обеспечения наиболее быстрой защиты", предоставляемой вакцинацией, "от передачи новых "проблемных" вариантов SARS-CoV-2", таких как вариант Delta.

Накануне еврокомиссар по вопросам здравоохранения Стелла Кириакидес заявила, что появляются доказательства того, что вариант Delta коронавируса SARS-CoV-2 "снижает прочность защитного щита", создаваемого вакцинами, призвав ускорить полную вакцинацию населения.

"Появились доказательства того, что варианты - а именно вариант Delta - снижают прочность защитного щита, создаваемого вакцинами, особенно когда вакцинация еще не завершена. Поэтому крайне важно, чтобы как можно больше граждан были вакцинированы против Ковид -19, и чтобы вакцинация была полной как можно скорее", - сказала Стелла Кириакидес.

Как возникают варианты исходного вируса

Все вирусы, включая SARS-CoV-2, вызывающий ковид-19, имеют тенденцию изменяться со временем и циркуляцией, хотя большинство изменений практически не влияют на их свойства.

Когда вирус создает копии самого себя, эти изменения считаются мутациями. Вирус с одной или несколькими новыми мутациями считается вариантом оригинала.

Некоторые мутации могут привести к изменению характеристик вируса, таких как его большая или меньшая способность к передаче инфекции, а также уровень или тяжесть заболевания, которое он может вызвать.

По данным ВОЗ, SARS-CoV-2, вызывающий ковид-19, имеет тенденцию изменяться медленнее, чем другие известные вирусы, например, Influenza, вызывающий грипп.

На сегодняшний день в различных частях мира выявлены сотни вариаций SARS-CoV-2, причем подавляющее большинство из них практически не влияют на свойства исходного коронавируса.

Всемирные усилия по изучению вариантов SARS-CoV-2

С самого начала пандемии ВОЗ сотрудничает с глобальной сетью специализированных исследовательских и испытательных лабораторий, чтобы лучше понять поведение SARS-CoV-2.

Эти исследовательские группы определяют последовательность SARS-CoV-2 и делятся результатами в открытых базах данных, включая GISAID, исследовательскую организацию, признанную Европейской комиссией, и партнера PREDEMICS, проекта по прогнозированию и профилактике зоонозных вирусов (с передачей от животных к человеку) с пандемическим потенциалом.

Это глобальное сотрудничество позволяет ученым со всего мира более эффективно и быстро отслеживать вирус и его мутации.

Глобальная лабораторная сеть ВОЗ также включает рабочую группу по эволюции SARS-CoV-2, специально предназначенную для выявления новых мутаций и оценки их прогнозируемого воздействия.

Как осуществляется этот мониторинг в Португалии

INSA координирует мониторинг распространения нового коронавируса в Португалии посредством анализа генома этого пандемического вируса.

Это исследование включает в себя сотрудничество с Научным институтом имени Гюльбенкяна (IGC), Институтом биомедицины (iBiMED, Университет Авейру), Институтом биосистем и интегративных наук (BioISI, Университет Лиссабона), Институтом исследований и инноваций в области здравоохранения (i3S) и Исследовательским центром биоразнообразия и генетических ресурсов (CIBIO, Университет Порту) для обработки образцов, а также с сетью из более чем 60 больниц и лабораторий по всей стране для отправки положительных образцов в INSA.

Исследование генетического разнообразия нового коронавируса SARS-CoV-2 (COVID-19) в Португалии" направлено на определение мутационных профилей SARS-CoV-2 для идентификации и мониторинга цепей передачи нового коронавируса, а также выявления новых случаев заноса вируса в Португалию.