在大流行期间检测到的数百个SARS-CoV-2变种中,葡萄牙卫生当局的注意力落在四个值得关注的变种上--Alpha、Beta、Gamma和Delta--在葡萄牙存在社区传播。
与英国有关的Alpha是这些变体中第一个在葡萄牙高发的变体,据估计,在5月份,它几乎是该国90%的新型冠状病毒感染病例的原因。
最近,人们的注意力转向了最初在印度发现的Delta变体,它被认为更具传播性,根据国家卫生当局的说法,它可能在几周内超过阿尔法,成为葡萄牙最流行的变体。
根据欧洲疾病预防和控制中心(ECDC)的数据,到8月底,SARS-CoV-2的Delta变体将占欧洲新感染病例的90%,入院和死亡人数也会增加。
世界卫生组织认为值得关注的变种
目前,世界卫生组织(WHO)已将四种 "值得关注的变体"(VOC)分类,并在5月下旬指定了希腊字母的名称以方便理解。
因此,在VOC类别中,Alpha,最初于2020年12月在英国检测到;Beta,自2020年12月以来与南非有关;Gamma,2021年1月在巴西发现;Delta,源自印度,今年5月被列为关注。
当出现以下一种或多种情况时,一个变异体被认为是值得关注的:病毒传播性增加,毒力增强或疾病的临床变化,以及社会和公共卫生措施、诊断、疫苗和现有治疗的有效性下降。
除VOCs外,世卫组织还将SARS-CoV2病毒的其他七种改变归为 "相关变体"(VOI),其中最后一种是Lambda,与秘鲁有关。
其他六个VOI是Epsilon(美国,最初在2020年3月检测到)、Zeta(巴西,2020年4月)、Eta(自2020年12月以来在几个国家)、Theta(菲律宾,2021年1月)、Iota(美国,2020年11月)和Kappa(印度,2020年10月)。
当一个变异体被确定为社区传播的原因并在几个国家检测到时,它就被认为是有意义的。
在葡萄牙具有社区传播的变体
被世卫组织列为关注的四个变体--Alpha、Beta、Gamma和Delta--在葡萄牙存在,并呈现社区传播,即在发生病例时不可能追踪感染源。
根据里卡多-豪尔赫博士国家卫生研究所(INSA)6月份的初步数据,Delta变体(B.1.617.2,与印度有关)的流行率在里斯本和Vale do Tejo地区超过60%,然而,在北部地区仍然低于15%。
国家统计局估计,Delta变体的传播程度比Alpha变体高约60%,Alpha变体与英国有关,5月期间在葡萄牙占主导地位。
然而,该研究所预测,德尔塔(Delta)在 "刺突 "蛋白上有多个突变,使其更有能力传播和躲避免疫系统,可能在未来几周内超过阿尔法。
关于与南非有关的Beta和在巴西马瑙斯发现的Gamma,截至6月16日,已经分别发现了133例和146例,这两个变体在该国也有社区传播。
变异体对疫苗效力的影响
世卫组织指出,新的SARS-CoV-2冠状病毒的Delta变体已经在92个国家流通,但保障疫苗对这一病毒株仍然有效,防止了严重疾病和死亡病例。
据世卫组织应对covid-19的技术负责人Maria Van Kerkhove周一表示,Delta变体 "正在迅速蔓延","比Alpha变体具有更大的传播性",最初在英国被诊断出。
玛丽亚-范克霍夫说,这些疫苗 "对Delta变种起作用",因为与其他病毒株一样,如果疫苗接种周期完成,它们可以防止严重的covid-19和死亡。
病毒学家Pedro Simas也认为,到目前为止,还没有出现SARS-CoV-2冠状病毒的变体,"破坏 "疫苗对covid-19的保护作用,强调它们在预防严重疾病和死亡方面都是有效的。
"这并不意味着非常罕见的病例不会出现,但我们不能只关注罕见的病例,现在我们必须着眼于共同利益,"这位专家告诉卢萨。
最近,卫生总局(DGS)决定将接种阿斯利康疫苗第二剂的间隔时间从12周减少到8周,以确保 "更快地保护 "SARS病毒的新 "关注变种 "的传播。CoV-2。
根据DGS的说法,VAXZEVRIA疫苗(原名阿斯利康)的接种计划是两剂,间隔时间为8至12周,"目前推荐的间隔时间为8周,以确保疫苗接种完成后 "对新的SARS-CoV-2关注(VoC)变体的传播 "提供最快的保护,例如Delta变体。
前一天,欧洲卫生专员Stella Kyriakides说,正在出现的证据表明,SARS-CoV-2冠状病毒的Delta变体 "降低了疫苗创造的保护的强度",敦促加快对人口的全面疫苗接种。
"有证据表明,变体--即Delta变体--削弱了疫苗提供的保护的强度,特别是在疫苗接种尚未完成的情况下。因此,尽可能多的公民接种covid -19疫苗是至关重要的,而且要尽快完全接种,"斯特拉-基里亚基德说。
原始病毒的变种如何产生
所有的病毒,包括引起covid-19的SARS-CoV-2,都倾向于随着时间和流通而变化,尽管大多数变化对其特性几乎没有影响。
当一个病毒对自己进行复制时,这些变化被认为是突变。具有一个或几个新突变的病毒被认为是原始病毒的变种。
一些变异可以导致病毒特征的改变,例如其更大或更小的传播能力以及它可以引起的疾病的水平或严重程度。
据世卫组织称,引起covid-19的SARS-CoV-2往往比其他已知病毒,如引起流感的流感,变化得更慢。
迄今为止,在世界各地已经发现了数百种SARS-CoV-2的变体,其中绝大多数对原始冠状病毒的特性没有什么影响。
了解SARS-CoV-2变种的全球努力
自大流行开始以来,世卫组织一直在与专业研究和测试实验室的全球网络合作,以更好地了解SARS-CoV-2的行为。
这些研究小组对SARS-CoV-2进行测序,并在公共数据库中分享结果,其中包括GISAID,这是一个被欧洲委员会认可的研究组织,也是PREDEMICS的合作伙伴,PREDEMICS是一个关于预测和预防具有大流行潜力的人畜共患病毒(从动物到人类传播)的项目。
这种全球合作使世界各地的科学家能够更有效和迅速地追踪病毒及其变异。
世卫组织全球实验室网络还包括一个关于SARS-CoV-2演变的工作组,专门负责检测新的变异并评估其可预测的影响。
在葡萄牙是如何进行这种监测的
INSA正在协调监测新冠状病毒在葡萄牙的传播,通过对这种大流行病毒的基因组分析。
这项研究涉及与Gulbenkian科学研究所(IGC)、生物医学研究所(iBiMED,阿威罗大学)、生物系统和综合科学研究所(BioISI,里斯本大学)、健康研究和创新研究所(i3S)以及生物多样性和遗传资源研究中心(CIBIO,波尔图大学)合作,进行样品处理,并与全国60多家医院和实验室组成的网络合作,向INSA发送正面样品。
葡萄牙新SARS-CoV-2冠状病毒(COVID-19)的遗传多样性研究 "旨在确定SARS-CoV-2的突变特征,以识别和监测新冠状病毒的传播链,以及识别葡萄牙新引入的病毒。