国家卫生博士里卡多-豪尔赫研究所（INSA）关于新冠状病毒遗传多样性的每周报告表明，源自印度并被认为是最具传播性的Delta变体在该国 "9月6日至12日的一周内的相对频率为100%"。

根据该文件，在迄今为止分析的该变体的总序列中，有66个在 "刺突 "蛋白上有一个额外的突变，这个亚系被称为 "Delta Plus"，但在最近几周没有报告病例。

关于与巴西有关的Gamma变体，在三周没有在分析的样本中检测到之后，在8月30日和9月5日之间的一周，在阿连特茹和里斯本以及Vale do Tejo地区记录了两个无关的病例。

根据INSA的数据，起源于英国并在葡萄牙流行的Alpha变体在过去五周内已停止流通。

Delta、Gamma、Beta和Alpha被世界卫生组织（WHO）列为关注变体（VOC），因为它们可能更具传播性，导致更严重的疾病，或具有允许逃避免疫系统的特性，可能降低疫苗的有效性。

作为持续监测SARS-CoV-2遗传多样性的一部分，自6月初以来，每周平均分析552个序列，这些样本是在葡萄牙大陆、亚速尔群岛和马德拉群岛的18个地区的实验室随机收集的，平均每周覆盖128个县市。

6月，该研究所宣布通过其持续监测，加强对在葡萄牙流通的引起Covid-19的病毒变体的监测。

据国家统计局称，这一战略使SARS-CoV-2的遗传特征得到了更好的描述，因为数据是连续分析的，分析之间不再有时间间隔，这些分析基本上是专门用于公共卫生要求的遗传特征的具体研究。