它们可以根据胚胎干细胞和成人干细胞的起源以及全能、多能或多能的潜力来分类。

这些细胞有许多治疗用途，有几项关于未来潜在治疗用途的研究取得了积极成果，还有一些需要在未来进一步调查。这些细胞也可以用于新的治疗系统和各种课题，如癌症治疗、心血管治疗和神经治疗，以及这些领域的一些未来科学应用。

干细胞可以根据其来源分为胚胎干细胞和成人干细胞。胚胎干细胞是在胚胎发育的初始阶段（胚胎发育的第4天和第6天之间）直接从胚胎中分离出来的，具有很大的分化能力；成人干细胞是存在于器官、胎儿和成人组织中的细胞，有不同的来源，如脐带血、胎盘、脂肪组织、骨髓、外周血和成熟组织。

脐带血代表了胚胎干细胞的主要来源之一，因为居住在那里的成人干细胞数量较少，因此，在再生医学领域，在造血移植和治疗各种血液肿瘤疾病方面，它成为一个非常有前途的细胞来源。

干细胞疗法，也被称为再生医学，利用干细胞或其衍生物促进病变、功能障碍或受伤组织的修复反应。它是器官移植的下一章，使用细胞而不是捐赠器官，因为捐赠器官的供应有限。这些干细胞被操纵成特定类型的细胞，如心肌细胞、血细胞或神经细胞。

然后，这些特化的细胞可以被植入一个人体内。例如，如果该人有心脏疾病，该细胞可以被注射到心肌中。然后，健康的移植心肌细胞可以帮助修复有缺陷的心肌。

研究人员已经表明，成人骨髓细胞被引导成为心脏样细胞，可以修复人的心脏组织，而且更多的研究正在进行。

在干细胞移植中，干细胞取代了因化疗或疾病而受损的细胞，或作为捐赠者的免疫系统对抗某些类型的癌症和血液相关疾病的一种方式，如白血病、淋巴瘤、神经母细胞瘤和多发性骨髓瘤。这些移植使用成人干细胞或脐带血。研究人员正在测试成人干细胞，以治疗其他疾病，包括一些退化性疾病，如心脏衰竭。

要使胚胎干细胞对人有用，研究人员必须确定干细胞将分化为所需的特定细胞类型。

研究人员已经发现了引导干细胞成为特定类型细胞的方法，例如引导胚胎干细胞成为心脏细胞。这一领域的研究正在进行中。

胚胎干细胞也可以不规则地生长，或自发地专门化为不同的细胞类型。研究人员正在研究如何控制胚胎干细胞的生长和分化。

胚胎干细胞也可能引发免疫反应，接受者的身体将干细胞作为外来入侵者进行攻击，或者干细胞可能只是无法正常运作，后果未知。研究人员继续研究如何避免这些可能的并发症。