L'INSA note cependant, dans son rapport hebdomadaire, qu'en raison de la cessation de l'état d'alerte le 1er octobre et de la modification des tests qui en a résulté, "il y a eu une forte baisse de l'incidence et de la valeur du Rt qui pourrait ne pas correspondre à une diminution réelle".

Les estimations de l'Institut national de la santé Ricardo Jorge indiquent que l'indice de transmissibilité était de 0,63 le 6 octobre et qu'il est passé à 0,92 le 15 octobre.

La valeur moyenne du Rt (nombre effectif de reproduction), entre le 11 et le 15 octobre, était de 0,88, sa valeur réelle se situant entre 0,87 et 0,89 avec un degré de confiance de 95%.

Le rapport indique une augmentation de l'indice de transmissibilité dans toutes les régions du pays par rapport à la semaine précédente, avec un Rt estimé à 0,84 dans le Nord, 0,88 dans le Centre, 0,89 à Lisbonne et Vale do Tejo, 0,79 dans l'Alentejo, 0,80 dans l'Algarve.

Seules les Açores (1,09) et Madère (1,22) ont un indice de transmissibilité supérieur au seuil de 1, selon les données.

Selon les estimations de l'INSA, au 15 octobre, 5 512 398 cas de Covid-19 étaient survenus au Portugal.

Dans la comparaison européenne, le Portugal a un taux de notification cumulé sur 14 jours compris entre 120 et 239,9 cas pour 100 000 habitants et un Rt inférieur à 1, soit un "taux de notification élevé avec une tendance à la baisse".